Bienestar Institucional en la Fundación Universitaria San Mateo, responde al Proyecto Educativo Institucional (P.E.I.) y a los requerimientos del Ministerio de Educación Nacional (M.E.N.), los cuales tienen como fin promover la sana convivencia, el fomento a la permanencia y graduación, apoyar al desarrollo cognitivo, espiritual, físico y psicosocial; mediante la generación de ambientes propicios, articulados con el desarrollo de acciones formativas, recreativas y de integración, atendiendo a la normatividad interna y externa.

Bienestar institucional cuenta con cuatro (4) programas (1)hábitos de vida saludable, (2)aporte al patrimonio natural y cultural, (3) construcción de comunidad y desarrollo Mateísta y (4) permanencia y graduación) entendidos como el conjunto de actividades y acciones que se orientan al desarrollo físico, socio-afectivo y social de la comunidad académica fomentando así el desarrollo integral, la permanencia, el sentido de pertenencia institucional, el aprovechamiento del tiempo libre mediante actividades que complementan la vida académica y administrativa, la sana convivencia, así como el desarrollo integral de los diferentes miembros pertenecientes a la comunidad Mateísta (estudiantes, docentes y administrativos).

Hábitos de vida saludable: Promueve mediante acciones deportivas y recreativas, el cuidado de la salud y la prevención de enfermedades, así mismo como el aprovechamiento del tiempo libre.

Aporte a la conservación del patrimonio natural y cultural: Reconoce y fomenta la diversidad cultural del país a través de la música, la danza y el teatro.

Construcción de comunidad institucional: Genera espacios mediante actividades disruptivas que contribuyen a la integración institucional, facilitando así el tránsito y adaptación de los estudiantes en la institución.

Permanencia y graduación: Genera acciones que permitan identificar las causas de deserción estudiantil con el fin de implementar estrategias que permitan mitigar la misma, así mismo brinda acompañamiento de carácter psicosocial.